该院设有急诊科等12个临床科室，建立了心血管、神经内科2个重点专科。医院拥有日产全自动生化分析仪、美国惠普彩超机、全自动血球分析仪等先进医疗设备。今日的东北师范大学医院已成为具有一定规模的二级乙等医院，承担全校教职学工家属及社区10万余人的医疗、预防、保健、康复及大学生健康教育任务。2000年医院通过深化改革、精简机构、优化组合、竞聘上岗，全院医务人员面貌焕然一新。为了配合国家医疗体制改革，与长春市职工基本医疗保险制度相接轨，今年年初全院实现了微机信息网络规划管理。实行了患者一日清单及病人选择医生制度。
医院有一只较强的科研骨干队伍，1998年以来，共撰写论文80篇。其中，在国家级杂志刊登40篇，省、市级杂志刊登20篇，省级科研项目1项，校级科研项目2项。
医院以服务对象为中心，积极开展三级预防工作，实行预防、治疗处方并行，方便患者就医，实施全面质量管理，全程优质服务，经济效益和社会效益显著提高，获长春市卫生系统“白求恩杯”竞赛优胜单位、“十大窗口”竞赛最佳窗口等殊荣。